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本產品Cas9 Nuclease(SpCas9),即CRISPR-associated endonuclease Cas9,是由大腸桿菌重組表達的Streptococcus pyogenes來源的RNA引導的序列特異性雙股DNA內切酶。 Cas9 Nuclease發揮雙股DNA內切酶活性必須依賴gRNA(也稱為sgRNA,single guide RNA)介導。 Cas9 Nuclease含有兩個切割活性位點,分別切割目標DNA的兩條鏈產生目標DNA雙股斷裂,其切割位點位於目標序列內,離PAM(5'-NGG-3')區3個鹼基的位置。如果標靶DNA雙股斷裂發生在細胞內,由於細胞本身的DNA修復系統會造成基因標靶位點的插入、缺失或替換,導致基因的缺失突變。
用途:體外gRNA篩選、體外gRNA引導特定雙股DNA剪切等。
來源:Streptococcus pyogenes來源核酸內切酶,大腸桿菌重組表現。
純度及濃度: SDS-PAGE檢測純度≥95%,無RNase殘留,無非gRNA依賴的DNase殘留,1 μM。
失活或抑制: 65℃條件下5 min完全失活。
酵素儲存緩衝液: 10 mM Tris-HCl, 300 mM NaCl, 1 mM DTT, 0.1 mM EDTA, 50%(v/v) glycerol,pH 7.4。
Cas9 Reaction Buffer(10х): 500 mM Tris-HCl, 1 M NaCl, 100 mM MgCl 2 , 1 mg/mL BSA, pH 7.9。
圖1. Cas9 Nuclease酶活性測試效果圖。反應體系:20 μL ddH 2 O、3 μL Cas9 Reaction Buffer(10х)、3 μL 300 nM gRNA(Target sequence:5'-ATATAAATCAGCATCCATGT-3')、1 μL Cas9 Nuclease(分別為4、2、1、0.2 pmol),25℃預孵育15 min(CT表示體係用1 μL Nuclease-free water取代Cas9 Nuclease),然後加入3 μL 30 nM的pET28a線性化質粒,37℃孵育15 min後終止反應,用1%瓊脂糖凝膠進行電泳分析。由圖中可看到gRNA與Cas9結合後,引導後者至pET28a與gRNA互補的序列酶切產生4314 bp和1324 bp的片段。
實驗步驟
1. 準備體外消化反應各種試劑(將Cas9 Nuclease、gRNA、底物DNA、Cas9 Reaction Buffer於冰浴上,gRNA稀釋至300 nM,底物DNA稀釋至30 nM);
2. 配製反應體系(以30 μL體系為例):
Reagent | Volume |
Nuclease-free water | 20 μL |
Cas9 Reaction Buffer(10х) | 3 μL |
gRNA(300 nM) | 3 μL |
Cas9 Nuclease(1 μM) | 1 μL |
Total Reaction Volume | 27 μL |
3. 渦旋混勻後室溫離心數秒,使液體聚於管底,25℃預孵育10 min;註:反應體系中可加入終濃度1U/μL的RNase Inhibitor,防止RNase污染(對應減少Nuclease-free water體積維持反應總體係不變)。
4. 再向系統中加入3 μL 30 nM的底物DNA(終體積30 μL),輕輕混勻後離心沉澱液體,37℃孵育15 min,反應時間可依實際情況適當延長30-120 min;
5. 反應結束後,每個樣品中加入1 μL蛋白酶K(20 mg/mL,貨號G1234)室溫孵育10 min(或65℃熱處理5-10 min);
6. 反應體係可以直接以適當濃度的瓊脂糖凝膠進行電泳分析。如不立即電泳,可將系統置於-20℃備用。
注意事項
1. 本產品使用需注意RNase-free、DNase-free相關操作,所使用試劑耗材都應確保Nuclease-free。
2. 酵素製品使用時應放在冰盒內或冰上,建議分裝使用,使用完畢後應立即置於-20℃保存。
3. 為了您的安全和健康,請穿著實驗服並戴上一次性手套操作。
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